De kleuren van een edelsteen worden bepaald door de chemische samenstelling van de steen. Maar als de chemische basisstructuur verschillende bijmengsels heeft of als de samenstelling van de basisstructuur afwijkt, is elke edelsteen anders van kleur. Kleurtherapie en andere energetische therapieën (acupunctuur, homeopathie, Bachbloesem, Reiki, ...) proberen de verstoorde harmonie in de trillingen met subtiele middelen te 'herstellen'. Je kiest een kleur, geluid of reuk om dit trillingsdefect te beïnvloeden.
Bij kleurtherapie en dus ook edelsteentherapie worden de verschillende trillingen in het lichtspectrum en de daarmee verbonden kleuren gebruikt.